Net als alle verwarmingsinstallaties of verluchtingssystemen vragen ook de units van een klimaatregeling een regelmatige onderhoudsbeurt. Meestal moet die jaarlijks uitgevoerd worden voor enkel een koelsysteem, en tweemaal per jaar voor reversibele systemen, die koelen en verwarmen. Toch is slechts een onderhoudsbeurt per jaar vaak voldoende, mits de gebruiker ongeveer driemaandelijks de filters reinigt en nagaat of de buitenunit niet door bladeren of ander vuil verstopt is.
De filters zijn heel eenvoudig te reinigen met een stofzuiger of zuiver water.

Over het onderhoud van de eigenlijke units kunnen we kort zijn: de vroegere modellen, waarbij roosters de ventilatie beschermden, worden tegenwoordig meer en meer vervangen door systemen met platte kanten die bijna geen onderhoud vragen.